بعد بداية بطيئة ، قامت الولايات المتحدة بتحديث نظام المراقبة الخاص بها لتتبع سلالات فيروس كورونا الجديدة مثل Omigran ، مما زاد من قدرتها بعشرات الآلاف من العينات أسبوعيا منذ بداية هذا العام.
تتطور الفيروسات باستمرار. للكشف عن الإصدارات الجديدة من فيروس كورونا ومراقبتها ، يحلل العلماء التركيب الجيني لجزء من العينات التي تم اختبارها إيجابية.
إنهم ينظرون إلى الكتابات الكيميائية للشفرة الجينية للفيروس للكشف عن طفرات مقلقة جديدة مثل Omigran ولمتابعة انتشار المتغيرات المعروفة مثل دلتا.
لقد كان جهدًا عالميًا ، ولكن حتى وقت قريب قدمت الولايات المتحدة أقل مساهمة. من خلال اختبارات التشتيت غير المنسقة ، انتشرت الولايات المتحدة أقل من 1٪ عينات إيجابية في وقت سابق من هذا العام. الآن ، يجري هذه الاختبارات على 5٪ إلى 10٪ من العينات. هذا مشابه جدًا لما تصنفه الدول الأخرى مشترك مع Global Disease Monitors خلال الوباء.
قالت كيلي فروبلفسكي ، مديرة الأمراض المعدية في رابطة مختبرات الصحة العامة: “المراقبة الجينية قوية”.
يساهم ما يقرب من 70 معملًا للصحة العامة على مستوى الولاية والمحلية في هذا الجهد ، حيث تتم معالجة 15000 إلى 20000 عينة كل أسبوع. تحقق مراكز السيطرة على الأمراض والوقاية منها والمختبرات الأخرى التي يديرها متعاقدوها ما مجموعه 40.000 إلى 80.000 أسبوعياً.
قبل تسعة أشهر ، تم تحليل حوالي 12000 عينة بهذه الطريقة كل أسبوع.
قال كيني بيكمان ، من جامعة مينيسوتا ، “نحن في مكان أفضل بكثير مما كنا عليه قبل عام أو ستة أو تسعة أشهر”. يدير مختبر علم الوراثة بالجامعة ، والذي يعالج الآن حوالي 1000 عينة أسبوعياً من ولايات بما في ذلك مينيسوتا وأركنساس وداكوتا الجنوبية. قبل عام ، لم يصدر المختبر أي طلب.
تقوم الولايات المتحدة ببناء شبكة وطنية لمراقبة طفرات فيروس كورونا بشكل أفضل ، بالاعتماد على فاتورة الرئيس جو بايدن للإغاثة من فيروس كورونا البالغة 1.7 مليار دولار.
ومع ذلك ، قال الدكتور ويليام موس من كلية جونز هوبكنز بلومبرج للصحة العامة إن حوالي عشرين دولة تحتل معدلات أعلى للعينات الإيجابية من الولايات المتحدة. ظهور أوميغرون “سيلهم الولايات المتحدة للقيام بعمل أفضل”.
قال موس: “أعتقد أنه لا يزال أمامنا طريق طويل لنقطعه”.
بعض الدول فرز قال الدكتور فيل فيبو ، كبير المسؤولين الطبيين في شركة Illumina ، ومقرها سان دييغو التي تصنع تقنيات التسلسل الجيني ، إن 1٪ فقط من العينات في نطاق 20٪.
قال فيبو: “يمكننا أن نكون أكثر منهجية وأكثر اتساقًا بشأن ذلك ، لذلك نتأكد من عدم وجود صحارى خاضعة للمراقبة وراثياً حيث يمكن أن نفقد مظهر التباين”.
يمكن لاختبارات PCR القياسية التي تستخدم مسحات الأنف المرسلة إلى المختبرات للمساعدة في جهود المراقبة أن تكشف عن وجود متغير omigron. إذا كان اختبار PCR إيجابيًا لاثنين فقط من الجينات المستهدفة الثلاثة – المعروفة باسم نتيجة اختبار التسرب S – فهي علامة على omicron قبل الخطوة التالية في تسلسل الجينات لإثبات ذلك.
قال تريفور بيدفورد ، عالم الأحياء وعلم الوراثة في مركز فريد هاتشينسون لأبحاث السرطان: “إنها صدفة”. “إذا كان عليك النشر لتحديد التباين ، فأنت دائمًا متأخر قليلاً ، ويكون الأمر أكثر تكلفة. إذا كنت تعتقد أن هذا التسرب من S يمكن التعرف عليه ، فهو سهل.”
وقال إن أنواعًا أخرى من نتائج اختبار تفاعل البوليميراز المتسلسل أثارت أيضًا هذا الشذوذ ، ولكن ليس متغير دلتا. وقال بيدفورد ، بما أن دلتا تهيمن حاليًا على الولايات المتحدة ، فسيتم ملاحظة قرار S-Dropout. (يتلقى بيدفورد تمويلًا من معهد هوارد هيوز الطبي ، والذي يدعم أيضًا قسم الصحة والعلوم في أسوشيتد برس.)
قال الدكتور أنطوني فاسي ، عالم الأوبئة الأبرز في البلاد ، إن دخول أوميغرون إلى الولايات المتحدة كان “حتميًا”.
قال العديد من الخبراء إنه قد يكون هنا بالفعل وسيتناوله قريبًا نظام المراقبة. لكن السؤال هو ماذا بعد ذلك؟
قال ديفيد أوكونور ، الباحث في الإيدز بجامعة ويسكونسن: “ليس لدينا قيود سفر بين الولايات للسيطرة على الفيروس في أي مكان”.
بدلاً من ذلك ، سيخبر Omigron سلطات المراقبة الجينية ما إذا كان ينتشر في مكان ما بسرعة غير عادية وما إذا كان سيتم إرسال المزيد من الأدلة إلى تلك الأماكن ، على حد قوله.
عندما يتم الكشف عن omigran ، يجب على مسؤولي الصحة العامة النظر في المتغيرات الأخرى في جهود الاختبار الخاصة بهم ، مثل كمية العدوى الموجودة بالفعل في هذا المجتمع ومعدل التطعيم. تفشي الأمراض الوخيمة في المناطق عالية التحصين تثير القلق بشكل خاص.
لكن بيكمان ، من جامعة مينيسوتا ، وجد أن التصنيفات مقلوبة إلى حد كبير.
وقال: “لكي تدرك مدى سرعة نموها ، لا يتعين عليك أن تتخطى نسبة قليلة في المائة في الحالات الإيجابية”.
على عكس بعض البلدان الأخرى ، لم يستخدم مسؤولو الحكومة الأمريكية القوة لفرض عزل الناس إذا تم اختبارهم بشكل إيجابي للتغيرات المثيرة للقلق. بناءً على ذلك ، يعد الفرز في الأساس أداة تتبع لمراقبة انتشار الطفرات.
وقال بيكمان: “أعتقد أنه من المهم تتبع الاختلافات ، لكن لا أعتقد أنه من العملي افتراض أنه يمكننا نشر نسخة مختلفة على مساراتها بسرعة وعلى نطاق واسع”.
___
ساهم كتاب الأسوشيتد برس لوران نيرغارد وماثيو بيروني وريكاردو ألونسو زالديفار.
___
يتم دعم قسم الصحة والعلوم في أسوشيتد برس من قبل معهد هوارد هيوز الطبي لتعليم العلوم. AP هي المسؤولة وحدها عن جميع المحتويات.
“متعصب للموسيقى. مستكشف متواضع جدا. محلل. متعصب للسفر. مدرس تلفزيوني متطرف. لاعب.”